担当教員

生物情報 領域

櫻井鉄也

櫻井鉄也 iD TRIOS researchmap

筑波大学 人工知能科学センター センター長
システム情報系　教授HP

研究分野：数理アルゴリズム
  1. データ解析における数理手法
  2. 大規模科学シミュレーションの高性能計算
  3. 固有値解析
GA

主な発表論文：

  1. “Distributed collaborative feature selection based on intermediate representation”, Proceedings of the 28th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI-19) 2019, 4142-4149.
  2. “Complex moment-based supervised eigenmap for dimensionality reduction”, Proceedings of the Thirty-Third AAAI Conference on Artificial Intelligence (AAAI-19) 2019, 3910-3918.
  3. “Spectral feature scaling method for supervised dimensionality reduction”, Proceedings of the 27th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI-18) 2018, 2560-2566.
宮崎剛

宮崎剛 iD researchmap

物質・材料研究機構 国際ナノアーキテクトニクス研究拠点 (WPI-MANA) MANA主任研究者 HP

筑波大学 グローバル教育院　
教授（協働大学院）

研究分野：電子状態計算
  1. 第一原理計算
  2. 分子シミュレーション
  3. 計算物質科学
GA

主な発表論文：

  1. “Efficient Calculation of Electronic Structure Using O(N) Density Functional Theory”, Journal of Chemical Theory and Computation 2017, 13 (9), 4146-4153.
  2. “Density-functional theory study of gramicidin A ion channel geometry and electronic properties”, Journal of The Royal Society Interface 2013, 10 (89), 20130547.
  3. “O(N) methods in electronic structure calculations”, Reports on Progress in Physics 2012, 75 (3), 036503.
二階堂愛

二階堂愛 iD researchmap

理化学研究所 生命機能科学研究センター チームリーダ HP

筑波大学 グローバル教育院　教授（協働大学院）

研究分野：ゲノム科学, バイオインフォマティクス
  1. 新しいゲノム科学の計測技術と計算技術の開発
GA

主な発表論文：

  1. “CellFishing.jl: an ultrafast and scalable cell search method for single-cell RNA sequencing”, Genome Biology 2019, 20 (1), 31.
  2. “Quartz-Seq2: a high-throughput single-cell RNA-sequencing method that effectively uses limited sequence reads”, Genome Biology 2018, 19 (1), 29.
  3. “Single-cell full-length total RNA sequencing uncovers dynamics of recursive splicing and enhancer RNAs”, Nature Communications 2018, 9 (1), 619.
桝屋啓志

桝屋啓志 iD researchmap

理化学研究所バイオリソース研究センター統合情報開発室
室長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：バイオインフォマティクス、情報統合
  1. バイオリソース関連情報データ統合・国際標準化・横断検索等の研究開発
  2. バイオリソースと情報のコミュニケーションツールとしてのホームページの拡充
  3. 大規模データ解析技術及びデータ可視化技術等の研究開発
GA

主な発表論文：

  1. “An atlas of evidence-based phenotypic associations across the mouse phenome.”, Sci. Rep. 2020, 10, 3957.
  2. “RIKEN MetaDatabase: A Database Platform for Health Care and Life Sciences as a Microcosm of Linked Open Data Cloud.”, Int. J. Semantic Web Inf. Syst. 2018, 14(1), 140-164.
  3. “Identification of genetic elements in metabolism by high-throughput mouse phenotyping.”, Nat. Commun. 2018, 9, 288.
青島 健

青島 健 iD

エーザイ株式会社 DHBL Microbes & Host Defense ドメインData & AI リード

筑波大学 グローバル教育院　教授（協働大学院）

研究分野：データサイエンス、バイオインフォマティクス
  1. ゲノムをはじめとする各種オミクスデータのハンドリング、可視化、ならびに臨床情報との統合解析によるバイオマーカー探索、薬剤作用機序解明、創薬仮説形成
  2. 人工知能（AI）をはじめとする高度な解析技術を活用したデータ駆動型創薬の加速
  3. レセプトデータをはじめとするリアルワールドデータのハンドリング、可視化、先端薬疫学的なアプローチ並びに医学統計解析によるアンメットメディカルニーズの解明および新規創薬ターゲットの創出

主な発表論文：

  1. “A Deep Learning Algorithm for Sleep Stage Scoring in Mice Based on a Multimodal Network with Fine-Tuning Technique.”, Neuroscience Research, 2021, 173, 99–105.
  2. “Database analysis of patients with hepatocellular carcinoma and treatment flow in early and advanced stages.” Pharmacology Research & Perspectives, 2019, 7(4):e00486, 8pages.
  3. “Identification of Prognostic Factors to Predict Cognitive Decline of Patients with Early Alzheimer’s Disease in the Japanese Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative Study.” Alzheimer’s Dementia: Translational Research & Clinical Interventions, 2019, 5(1), 364-373.
Dai Hai Nguyen

滝沢 穂高 iD TRIOS researchmap

筑波大学 システム情報系 教授HP
筑波大学学術情報メディアセンター　センター長

研究分野：知的画像処理
 

主な発表論文：

  1. “Kinect cane: an assistive system for the visually impaired based on the concept of object recognition aid Personal and Ubiquitous Computing”, Springer 2015, Vol.19, No.5-6, pp.955-965.
  2. “Segmentation of cervical intervertebral disks in videofluorography by CNN, multi channelization and feature selection International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery”, Springer 2020，Vol.15, No.4, pp.1-8.
  3. “Preprocessing Optimization and Semantic Segmentation for Extraction of Cervical Intervertebral Disks from Videofluorography Proceedings of 2022 26th International Conference on Pattern Recognition (ICPR)”, IEEE, Part A: Civil Engineering 2022，pp.4948-4952.
Yasunori Futamura

二村保徳 iD TRIOS researchmap

筑波大学 システム情報系 准教授

研究分野：高性能計算
  1. Parallel algorithms for numerical linear algebra
  2. High-performance graph algorithm
  3. Dimensionality reduction and clustering
 
 

主な発表論文：

  1. “Structural analysis based on unsupervised learning: Search for a characteristic low-dimensional space by local structures in atomistic simulations”, PHYSICAL REVIEW B 2022, 105 (7), 075107.
  2. “Spectral Graph Partitioning Using Geodesic Distance-based Projection”, IEEE High Performance Extreme Computing Conference (HPEC) 2021, 1-7.
  3. “Spectral anomaly detection in large graphs using a complex moment-based eigenvalue solver”, ASCE-ASME Journal of Risk and Uncertainty in Engineering Systems, Part A: Civil Engineering 2020, 6 (2), 040200102.
Ye Xiucai

叶 秀彩 iD TRIOS researchmap

筑波大学 システム情報系 准教授

研究分野：機械学習、バイオインフォマティクス
  1. 機械学習アルゴリズム
  2. 遺伝子発現データ解析
  3. AI創薬
 
 

主な発表論文：

  1. “Interactive gene identification for cancer subtyping based on multi-omics clustering”, Methods , 2023, 211, 61-67.
  2. “Distributed Collaborative Feature Selection Based on Intermediate Representation”, IJCAI, 2019, 4142-4149.
  3. “Multiview network embedding for drug-target Interactions prediction by consistent and complementary information preserving”, Briefings in Bioinformatics, 2022, 23 (3), 1-13.
Dai Hai Nguyen

Dai Hai Nguyen iD TRIOS researchmap

筑波大学 システム情報系 助教HP

領域コーディネーター

研究分野：数理情報学
  1. 機械学習
  2. データ分析
  3. バイオインフォマティクス
 

主な発表論文：

  1. “On A Linear Fused Gromov-Wasserstein Distance For Graph Structured Data”, Pattern Recognition 2023, 138, 109351.
  2. “Learning subtree pattern importance for Weisfeiler-Lehman based graph kernels”, Machine Learning 2021, 110 (7), 1585-1607.
  3. “ADAPTIVE: leArning DAta-dePendenT, concIse molecular VEctors for fast, accurate metabolite identification from tandem mass spectra.”, Bioinformatics 2019, 35(14), 164-172.

食料革新 領域

礒田博子

礒田博子 iD TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系 教授 HP

研究分野：食品機能学
  1. 食資源の機能性解析と有効利用に関わる国際的研究
  2. 機能性食品および化粧品シーズに関わる食資源成分の解析
  3. 食品と環境のリスクアセスメント

主な発表論文：

  1. “Olive leaf tea may have hematological health benefit over green tea”, Clinical Nutrition, 2019, 38 (6), 2952-2955.
  2. “Modulation of the neurotransmitter systems through the anti-inflammatory and antidepressant-like effects of squalene from Aurantiochytrium sp.”, PLOS ONE 2019, 14 (6), e0218923.
  3. “Depigmenting effect of argan press-cake extract through the down-regulation of Mitf and melanogenic enzymes expression in B16 murine melanoma cells”, Cytotechnology 2018, 70 (5), 1389-1397.
川崎晋

川崎晋 researchmap

農業・食品産業技術総合研究機構 食品研究部門食品流通・安全研究領域
食品安全・信頼グループ 上級研究員 HP

筑波大学 グローバル教育院　教授（協働大学院）

研究分野：食品微生物学/食品衛生
  1. 食中毒菌および食品腐敗細菌のリスクの評価と制御
  2. 食中毒菌の迅速検査法開発と評価
  3. 小売店舗における食中毒菌の動向

主な発表論文：

  1. “Inactivation of Escherichia coli O157 and Salmonella Enteritidis in raw beef liver by gamma irradiation”, Food Microbiology 2019, 78, 110-113.
  2. “Predictive Modeling for the Growth of Salmonella Enteritidis in Chicken Juice by Real-Time Polymerase Chain Reaction”, Foodborne Pathogens and Disease 2018, 15 (7), 406-412.
  3. “Evaluation of TA10 Broth for Recovery of Listeria monocytogenes from Ground Beef”, Journal of AOAC International 2017, 100 (2), 470-473.
小林功

小林功 iD researchmap

農業・食品産業技術総合研究機構 食品研究部門食品加工・素材研究領域
食品加工グループ 上級研究員 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：マルチスケール食品工学
  1. マイクロ・ナノチャネル乳化を利用した単分散エマルションの製造技術の開発
  2. 機能性成分を内包した食品用マイクロカプセルの設計・開発
  3. 食品用のヒト胃腸消化シミュレーターの開発および応用

主な発表論文：

  1. “Asymmetric straight-through microchannel arrays made of aluminum for producing monodisperse O/W emulsions”, Particulate Science and Technology 2020, 38 (6), 747-755, Published online 2019.
  2. “Microchannel emulsification: A promising technique towards encapsulation of functional compounds”, Critical Reviews in Food Science and Nutrition 2017, 58 (14), 2364-2385.
  3. “Development and Fundamental Characteristics of a Human Gastric Digestion Simulator for Analysis of Food Disintegration”, Japan Agricultural Research Quarterly: JARQ 2017, 51 (1), 17-25.
池⽻⽥晶⽂

池⽻⽥晶⽂ iD

農業・食品産業技術総合研究機構 食品研究部門食品流通・安全研究領域
分析評価グループ グループ長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：分析化学、食品科学、物理化学
  1. 非破壊分光法とオミクス手法の融合によるデータ駆動科学
  2. 非侵襲的な生体分光分析法の開発
  3. 各種分光手法の食品分析への応用
GA

主な発表論文：

  1. “The relationship between perceived freshness and water content of cabbage leaves: A near infrared imaging survey of substance distribution underlying product appearance”, LWT 2021, 139, 110523.
  2. “An examination of the principle of non-destructive flesh firmness measurement of peach fruit by using VIS-NIR spectroscopy”, Heliyon 2018, 4(2), e00531.
  3. “Identification of informative bands in the short-wavelength NIR region for non-invasive blood glucose measurement “, Biomedical Optics Express 2016, 7 (7), 2729-2737.
日下部裕子

日下部裕子 iD

農業・食品産業技術総合研究機構 食品研究部門食品健康機能研究領域
健康・感覚機能グループ グループ長補佐 HP

筑波大学 グローバル教育院 准教授（協働大学院）

研究分野：食品科学/分子生理学
  1. 味覚など口腔感覚の受容機構に関する研究
  2. 口腔刺激に伴う生理応答に関する研究
  3. 摂食中の感覚変動に関する研究

主な発表論文：

  1. “Distinct Human and Mouse Membrane Trafficking Systems for Sweet Taste Receptors T1r2 and T1r3;, PLOS ONE 2014, 9 (7), e100425.
  2. “Evaluation of Taste Solutions with or without Aromas Based on the Relationship between Individual Resting and Stimulated Salivation”, Food Science and Technology Research 2020, 26(3), 451-457.
  3. “Relationships between the response of the sweet taste receptor, salivation toward sweeteners, and sweetness intensity”, Food Science & Nutrition 2021, 9 (2), 719-727.
小林正智

小林正智

理化学研究所 バイオリソース研究センター
実験植物開発室 室長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：植物リソース学
  1. 次世代育種戦略の創出を目指したモデル植物の新規リソースと技術の開発
  2. モデル植物のリソースと情報を駆使した次世代植物保護技術の整備
  3. シロイヌナズナの多様性を活用した植物の環境適応機構の解析

主な発表論文：

  1. “Involvement of phosphatidylinositol metabolism in aluminum-induced malate secretion in Arabidopsis”, Journal of Experimental Botany 2019, 70 (12), 3329–3342.
  2. “STOP1 regulates the expression of HsfA2 and GDHs that are critical for low-oxygen tolerance in Arabidopsis”, Journal of Experimental Botany 2019, 70 (12), 3297–3311.
  3. “Genome-wide Association Study Reveals that the Aquaporin NIP1;1 Contributes to Variation in Hydrogen Peroxide Sensitivity in Arabidopsis thaliana”, Molecular Plant 2017, 10 (8), 1082-1094.
柏木健一

柏木健一 iD TRIOS researchmap

筑波大学 人文社会系 教授 HP

研究分野：開発経済学、中東・北アフリカ経済研究
  1. 農業・食品産業における生産性と技術進歩メカニズム解明
  2. 地場産業育成による産地発展分析
  3. 革新的食料バリュチェーン構築分析
GA

主な発表論文：

  1. “Technical Efficiency of Olive-growing Farms in the Northern West Bank of Palestine”, Sustainable Agriculture Research 2017, 6(1), 125-140.
  2. “Technical efficiency of olive oil firms under the industrial upgrading programme in Tunisia”, New Medit: A Mediterranean Journal of Economics, Agriculture and Environment 2016, 15(4), 10-20.
  3. “Productivity Growth and Technological Progress in the Palestinian Economy: Empirical Evidence from the West Bank”, Advances in Management & Applied Economics 2016, 6(1), 69-88.
Marcos Antonio Das NEVES

Marcos Antonio Das NEVESiD TRIOS

筑波大学 生命環境系 准教授 researchmap 

研究分野：食品工学
  1. フードナノテクノロジー
  2. 機能性食品の研究開発
  3. 食品機能性成分送達システムの開発
GA GA

主な発表論文：

  1. “Assessment of Oxidative Stability in Fish Oil-in-Water Emulsions: Effect of Emulsification Process, Droplet Size and Storage Temperature”, Journal of Food Process Engineering 2015, 40 (1), e12316.
  2. “Antimicrobial Oil-in-Water Nanoemulsions: Synergistic Effect of Nisin and Carvacrol against Bacillus subtilis”, Journal of Food Science and Engineering 2016, 6 (2), 63-74.
  3. “Development of novel bioactives delivery systems by micro/nanotechnology”, Current Opinion in Food Science 2015, 1, 7-12.
福光　聡

福光　聡

株式会社ニップン 中央研究所　イノベーションセンター 機能性素材チーム　チームマネジャー

筑波大学 グローバル教育院　准教授（協働大学院）

研究分野：機能性食品の研究開発
  1. 機能性食品成分の探索
  2. 機能性食品素材の製造プロセスの開発と実用化
  3. 機能性成分の食品機能性研究

主な発表論文：

  1. “Dietary Omega-3 Fatty Acid Dampens Allergic Rhinitis via Eosinophilic Production of the Anti-Allergic Lipid Mediator 15-Hydroxyeicosapentaenoic Acid in Mice”, Nutrients 2019, 11 (12), 2868.
  2. “The Anti‐Arthritis Effect of Olive‐Derived Maslinic Acid in Mice is Due to its Promotion of Tissue Formation and its Anti‐Inflammatory Effects”, Mol Nutr Food Res. 2019, 63 (3), e1800543.
  3. “Anti‐inflammatory and anti‐arthritic effects of pentacyclic triterpenoids maslinic acid through NF‐κB inactivation”, Mol Nutr Food Res. 2016, 60 (2), 399-409.
高橋真哉

高橋真哉 iD TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系 准教授HP

研究分野：植物由来機能性成分の生理機能解析
  1. 植物生長調整剤を用いた機能性成分産生手法の開発
  2. 抗炎症効果を持つ天然由来成分に関する研究
  3. 動物培養細胞を用いた植物由来成分の生理活性に関する研究

主な発表論文：

  1. “Effect of prohydrojasmon on total phenolic content, anthocyanin accumulation and antioxidant activity in komatsuna and lettuce”, Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 2020, 84(1)176-184.
  2. “Human Amniotic Epithelial Cells as a Tool to Investigate the Effects of Cyanidin 3-O-Glucoside on Cell Differentiation ;, International Journal of Molecular Sciences 2021, 22, 3768.
  3. “Ethanol Extract of Aurantiochytrium mangrovei 18W-13a Strain Possesses Anti-inflammatory Effects on Murine Macrophage RAW264 Cells”, Frontiers in Physiology 2018, 9, 1205.
Farhana Ferdousi

Farhana Ferdousi iD TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系 助教
領域コーディネーター

研究分野：オミックス研究および臨床試験/介入研究
  1. オミクス研究
  2. 臨床試験・介入研究

主な発表論文：

  1. “A Descriptive Whole-Genome Transcriptomics Study in a Stem Cell-Based Tool Predicts Multiple Tissue-Specific Beneficial Potential and Molecular Targets of Carnosic Acid”, International Journal of Molecular Sciences 2013, 24 (9), 8077.
  2. “Antidepressant- and anxiolytic-like activities of Rosmarinus officinalis extract in rodent models: Involvement of oxytocinergic system”, Biomedicine & Pharmacotherapy 2021, 144:112291.
  3. “Olive leaf tea may have hematological health benefit over green tea”, Clinical Nutrition 2019, 38(6), 2952-2955.

環境制御 領域

鈴木石根

鈴木石根 iD TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系 教授 HP

研究分野：光合成機能制御学
  1. 微細藻類の炭素・窒素代謝の相互作用の研究
  2. 光合成機能の環境適応機構の解析
  3. 微細藻類によるバイオマス生産に関連した生化学・分子生物学的研究
GA

主な発表論文：

  1. “Cold-regulated genes under control of the cold sensor Hik33 in Synechocystis”, Molecular Microbiology 2001, 40 (1), 235-244.
  2. “The pathway for perception and transduction of low-temperature signals in Synechocystis”, The EMBO Journal 2000, 19 (6), 1327-1334.
  3. “Genetic engineering of the unsaturation of fatty acids in membrane lipids alters the tolerance of Synechocystis to salt stress”, Proceedings of the National Academy of Sciences 1999, 96 (10), 5862-5867.
田村憲司

田村憲司 TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系 教授 HP

研究分野：土壌環境化学
  1. 土壌微量元素の解析
  2. 高性能土壌の機能解析
GA GA

主な発表論文：

  1. “Interregional traceability of Tunisian olive oils to the provenance soil by multielemental fingerprinting and chemometrics”, Food Chemistry 2019, 283, 656-664.
  2. “Six-year monitoring of the vertical distribution of radiocesium in three forest soils after the Fukushima Dai-ichi Nuclear Power Plant accident”, Journal of Environmental Radioactivity 2018, 192, 172-180.
  3. “Physiological and Psychological Effects of Scent of Soil on Human Beings”, Open Journal of Soil Science 2017, 07 (09), 235-244.
青野光子

青野光子 researchmap

国立環境研究所 生物多様性領域
副領域長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：植物環境ストレス機構学
  1. 対流圏オゾン等の広域環境変動における環境ストレス要因が植物に与える影響の分子生物学的研究
  2. 野外一般環境における遺伝子組換え作物の動態
GA

主な発表論文：

  1. “Ozone-Sensitive Arabidopsis Mutants with Deficiencies in Photorespiratory Enzymes”, Plant and Cell Physiology 2017, 58 (5), 914-924.
  2. “Seeds of a Possible Natural Hybrid between Herbicide-Resistant Brassica napus and Brassica rapa Detected on a Riverbank in Japan”, GM Crops 2011, 2 (3), 201-210.
  3. “Disruption of a Gene Encoding C4-Dicarboxylate Transporter-Like Protein Increases Ozone Sensitivity Through Deregulation of the Stomatal Response in Arabidopsis thaliana”, Plant and Cell Physiology 2008, 49 (1), 2-10.
菊池正紀

菊池正紀iD researchmap

物質・材料研究機構　高分子・バイオ材料研究センター　
バイオ材料分野　バイオセラミックスグループ グループリーダー HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：生体セラミックス
  1. 医療用セラミックス
  2. 生体由来鉱物の有効活用
  3. 生体模倣材料
GA

主な発表論文：

  1. “Preparation of anti-decay self-setting pastes of hydroxyapatite/collagen utilizing (3-glycidoxypropyl)trimethoxysilane”, Journal of Asian Ceramic Societies 2018, 6 (4), 322-331.
  2. “Reactivity Improvement of Dicalcium Phosphate Dihydrate with Fluoride for Its Removal from Waste and Drinking Water”, Universal Journal of Materials Science 2016, 4 (3), 60-64.
  3. “Self-organization mechanism in a bone-like hydroxyapatite/collagen nanocomposite synthesized in vitro and its biological reaction in vivo”, Biomaterials 2001, 22 (13), 1705-1711.
小林正智

小林正智

理化学研究所 バイオリソース研究センター
実験植物開発室 室長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：植物リソース学
  1. 次世代育種戦略の創出を目指したモデル植物の新規リソースと技術の開発
  2. モデル植物のリソースと情報を駆使した次世代植物保護技術の整備
  3. シロイヌナズナの多様性を活用した植物の環境適応機構の解析

主な発表論文：

  1. “Involvement of phosphatidylinositol metabolism in aluminum-induced malate secretion in Arabidopsis”, Journal of Experimental Botany, 2019, 70 (12), 3329–3342.
  2. “STOP1 regulates the expression of HsfA2 and GDHs that are critical for low-oxygen tolerance in Arabidopsis”, Journal of Experimental Botany, 2019, 70 (12), 3297–3311.
  3. “Genome-wide Association Study Reveals that the Aquaporin NIP1;1 Contributes to Variation in Hydrogen Peroxide Sensitivity in Arabidopsis thaliana”, Molecular Plant 2017, 10 (8), 1082-1094.
大熊盛也

大熊盛也

理化学研究所 バイオリソース研究センター
微生物材料開発室 室長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：微生物資源・多様性学
  1. 難培養微生物のゲノム科学と資源化に関する研究
  2. 共生微生物の分子生態学的研究
  3. 微生物の系統分類学的研究
GA

主な発表論文：

  1. “Isolation and characterization of a thermophilic sulfur- and iron-reducing thaumarchaeote from a terrestrial acidic hot spring”, The ISME Journal, 2019, 13(10), 2465–2474.
  2. “Lactococcus reticulitermitis sp. nov., isolated from the gut of the subterranean termite Reticulitermes speratus”, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 2018, 68 (2), 596-601.
  3. “Acetogenesis from H2plus CO2and nitrogen fixation by an endosymbiotic spirochete of a termite-gut cellulolytic protist”, Proceedings of the National Academy of Sciences 2015, 112 (33), 10224-10230.
大村嘉人

大村嘉人 iD

国立科学博物館 植物研究部
菌類・藻類研究グループ グループ長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：分類学を基盤とした地衣類学とその学際的応用
  1. 日本および関連アジア地域における地衣類多様性の解明
  2. 地衣類と大気環境変遷に関する研究
  3. 地衣類を構成する共生菌および共生藻の進化的関係に関する研究

主な発表論文：

  1. “Contribution to the Knowledge of the Lichen Mycota of Myanmar (I) Twenty Species Newly Recorded from Southern Myanmar”, Taiwania2020,65(4), 548-558.
  2. “137Cs concentrations in foliose lichens within Tsukuba-city as a reflection of radioactive fallout from the Fukushima Dai-ichi Nuclear Power Plant accident”, Journal of Environmental Radioactivity2015, 141, 38-43.
  3. “Photobiont diversity within populations of a vegetatively reproducing lichen, Parmotrema tinctorum, can be generated by photobiont switching”, Symbiosis 2019, 77, 59-72.
辻智也

辻智也 iD

マレーシア工科大学 マレーシア日本国際工科院
教授 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（グローバル教育院）

研究分野：化学工学熱力学
  1. 次世代スプレー噴霧剤に関する相平衡関係
  2. 有機溶媒に対するガス溶解度の測定と推算
  3. ジメチルエーテルに関する相平衡物性
GA

主な発表論文：

  1. “Measurement and prediction of bubble point pressure of a novel solvent with propellant for color spray”, Fluid Phase Equilibria 2020, 505, 112366.
  2. “Gas solubilities of nitrogen or oxygen in benzene, divinylbenzene, styrene and of an equimolar (N2:O2) mixture in styrene at (293–313) K”, Fluid Phase Equilibria, 2019, 492, 34-40.
  3. “SO2 Solubility in Low Molecular Weight Polyethylene Glycol Dimethyl Ether and Correlation using Cubic Equation of State”, Journal of Solution Chemistry 2019, 48, 1035-1045.
吉松嘉代

吉松嘉代 researchmap

医薬基盤・健康・栄養研究所 薬用植物資源研究センター
センター長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：薬用植物の植物細胞工学
  1. 植物組織培養による薬用植物の効率的増殖方法の開発
  2. 薬用植物の形質転換に関する研究
  3. 植物工場における薬用植物の生産に関する研究

主な発表論文：

  1. “Inhibitory effect of black ginger (Kaempferia parviflora ) constituents on nitric oxide production”, Japanese Journal of Food Chemistry and Safety 2018, 25 (3), 152-159.
  2. “オウゴンの加工調製法ならびに栽培年数が成分に与える影響と一酸化窒素産生抑制活性について”, 生薬学雑誌 2016, 70 (1), 1-9.
  3. “Two New Labdane Diterpenes from Fresh Leaves of Leonurus japonicus and Their Degradation during Drying”, Chemical and Pharmaceutical Bulletin 2013, 61 (5), 497-503.
河野徳昭

河野徳昭

医薬基盤・健康・栄養研究所 薬用植物資源研究センター 筑波研究部 育種生理研究室室長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：生薬学・天然物化学
  1. 薬用植物・生薬の遺伝的多様性に関する研究
  2. 薬用植物資源の維持及び増殖に関する研究
  3. 薬用植物総合情報データベース(MPDB)の開発

主な発表論文：

  1. “Isolation of Artemisia capillaris membrane-bound di-prenyltransferase for phenylpropanoids and redesign of artepillin C in yeast”,Commun Biol, 2, 384 (2019).
  2. “Studies on the Cultivation of Alisma orientale. III Cultivation in the Paddy Field on Iriomote Island”,The Japanese Journal of Pharmacognosy, 72 (1), 8-14 (2018).
  3. “Total biosynthesis of opiates by stepwise fermentation using engineered Escherichia coli“,Nature communications, 7, 10390 (2016).
松尾洋孝

松尾洋孝 researchmap

医薬基盤・健康・栄養研究所 薬用植物資源研究センター
主任研究員 HP

筑波大学 グローバル教育院　
准教授（協働大学院）

研究分野：生薬学・天然物化学
  1. 国内野生植物の利活用に関する研究
  2. 上皮間葉転換をターゲットとした新規抗癌剤の探索
  3. 未利用植物資源の利活用に関する研究

主な発表論文：

  1. “Screening for sulfur compounds by molybdenum-catalyzed oxidation combined with liquid chromatography-mass spectrometry.” Molecules 2020, 25(2), 240.
  2. “Nanaomycin K, a new epithelial-mesenchymal transition inhibitor, produced by actinomycete strain “Streptomyces rosa subsp. notensis” OS-3966.”, J. Biosci. Bioeng. 2020, 70 (1), 291-295.
  3. “Thioporidiols A and B: Anti-fungal sulfur compounds discovered by molybdenum-catalyzed oxidation screening from Trichoderma polypori FKI-7382.”, Antibiotics 2020, 9, 236.
原啓文

原啓文 iD

東京大学大学院 農学生命科学研究科
応用生命工学専攻 特任准教授 HP

筑波大学 グローバル教育院 准教授（グローバル教育院）

研究分野：熱帯環境微生物学
  1. 熱帯の様々な環境下における微生物群叢の比較解析
  2. 未利用バイオマス変換に資する熱帯微生物の解析と応用
  3. 熱帯地域における環境汚染物質のバイオレメディエーションに関する研究
GA

主な発表論文：

  1. “Microbial Diversity in Decaying Oil Palm Empty Fruit Bunches (OPEFB) and Isolation of Lignin-degrading Bacteria from a Tropical Environment”, Microbes and Environments 2019, 34 (2), 161-168.
  2. “Whole gene transcriptomic analysis of PCB/biphenyl degrading Rhodococcus jostii RHA1″, The Journal of General and Applied Microbiology, in press.
  3. “Depolymerization of lignocellulose of oil palm empty fruit bunch by thermophilic microorganisms from tropical climate”, Bioresource Technology 2019, 279, 174-180.
中山剛

中山剛 TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系 准教授 HP

研究分野：原生生物系統分類学
  1. 原生生物（特に微細藻、鞭毛虫）の分類学
  2. 湖沼における原生生物相の解明
  3. 有用原生生物の探索

主な発表論文：

  1. “Taxonomic study of a new eustigmatophycean alga, Vacuoliviride crystalliferum gen. et sp. nov.”, Journal of Plant Research 2014, 128 (2), 249-257.
  2. “Phylogeny and ultrastructure of Nephroselmis and Pseudoscourfieldia (Chlorophyta), including the description of Nephroselmis anterostigmatica sp. nov. and a proposal for the Nephroselmidales ord. nov”, Phycologia 2007, 46 (6), 680-697.
  3. “The Basal Position of Scaly Green Flagellates among the Green Algae (Chlorophyta) is Revealed by Analyses of Nuclear-Encoded SSU rRNA Sequences”, Protist 1998, 149 (4), 367-380.
雷中方

雷中方 iD TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系 准教授

研究分野：環境工学・排水および廃棄物処理
  1. 高強度の有機・窒素・リン排水処理と資源回収
  2. 有機性廃棄物の資源化
  3. 重金属の除去及び固定化による除染

主な発表論文：

  1. “Hydrothermal treatment as pre- and post-treatment of anaerobic digestion of primary sludge: Focus on energy balance, resources transformation and sludge dewaterability.”, Applied Energy 2019, 239, 171-180.
  2. “Enhanced hydrolysis and acidification of cellulose at high loading for methane production via anaerobic digestion supplemented with high mobility nanobubble water.”, Bioresource Technology 2020, 297, 122499.
  3. “Identification of inorganic and organic species of phosphorus and its bio-availability in nitrifying aerobic granular sludge.”, Water Research 2015, 68, 423-431.
宮崎亮

宮崎亮 iD researchmap

産業技術総合研究所 生物プロセス研究部門
研究グループ長 HP

筑波大学 グローバル教育院 准教授（協働大学院）

研究分野：微生物生態学
  1. 微生物の表現型ゆらぎとダイナミクスの解明
  2. 微生物叢形成機序と共生機構の解明
  3. 生物機能操作・制御とその応用技術開発
GA

主な発表論文：

  1. “Vast Differences in Strain-Level Diversity in the Gut Microbiota of Two Closely Related Honey Bee Species”, Current Biology 2020, 30(13), Pages 2520-2531.e7.
  2. “Deep Sequencing Uncovers Caste-Associated Diversity of Symbionts in the Social Ant Camponotus japonicus”, mBio 2020, 11(2), 10.1128.
  3. “A novel system of bacterial cell division arrest implicated in horizontal transmission of an integrative and conjugative element”, PLOS GENETICS 2019, 15(10), e1008445.
高橋真哉

高橋真哉 iD TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系 准教授HP
領域コーディネーター

研究分野：植物環境応答生理学
  1. 紫外線・放射線が植物に与える影響に関する研究
  2. 植物培養細胞を用いた放射線モニタリングに関する研究
  3. 藻類バイオマスの機能性成分としての利用に関する研究
 

主な発表論文：

  1. “Prohydrojasmon Promotes the Accumulation of Phenolic Compounds in Red Leaf Lettuce”, Plants (Basel, Switzerland) 2021, 10 1920.
  2. “Quantification of Ultraviolet-B Stress-Induced Changes in Nuclear and Cellular Sizes of Tobacco Bright Yellow-2 Cells”, CYTOLOGIA 2019, 84, 347-351.
  3. “Differential responses to high- and low-dose ultraviolet-B stress in tobacco Bright Yellow-2 cells”, Frontiers in Plant Science 2015, 6, 254.

 

生体分子材料 領域

市川創作

市川創作 iD TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系　教授
プログラムリーダー

研究分野：機能性キャリア開発工学
  1. エマルションキャリアシステムの開発と特性解明
  2. リポソームキャリアシステムの開発と特性解明
  3. 生理活性成分の効率的送達のための新規ナノ/マイクロキャリアシステムの開発
GA

主な発表論文：

  1. “Freeze-dryable lipid vesicles with size tunability and high encapsulation efficiency prepared by the multiple emulsification-solvent evaporation method”, Colloids and Surfaces B: Biointerfaces 2017, 159, 412-418.
  2. “Mixing characterization of liquid contents in human gastric digestion simulator equipped with gastric secretion and emptying”, Biochemical Engineering Journal 2017, 122, 85-90.
  3. “Development and Fundamental Characteristics of a Human Gastric Digestion Simulator for Analysis of Food Disintegration”, Japan Agricultural Research Quarterly: JARQ 2017, 51 (1), 17-25.
Shinji Sugiura

杉浦慎治 iD researchmap

産業技術総合研究所 細胞分子工学研究部門
AIST-INDIA機能性資源連携研究室　副連携研究室長　HP

筑波大学 グローバル教育院　
教授（協働大学院）

研究分野：生物化学工学
  1. Organs-on-a-chip デバイスの開発と創薬への応用
  2. 細胞培養における微小環境制御技術の開発
  3. 機能性材料を利用した細胞プロセス工学に関する研究
GA

主な発表論文：

  1. “A multi-throughput multi-organ-on-a-chip system on a plate formatted pneumatic pressure-driven medium circulation platform”, Lab on a Chip 2018, 18 (1), 115-125.
  2. “Morphology-based optical separation of subpopulations from a heterogeneous murine breast cancer cell line”, PLOS ONE 2017, 12 (6), e0179372.
  3. “Click-crosslinkable and photodegradable gelatin hydrogels for cytocompatible optical cell manipulation in natural environment”, Scientific Reports 2015, 5 (1), 15060.
亀田恒徳

亀田恒徳 iD researchmap

農業・食品産業技術総合研究機構 生物機能利用研究部門絹糸昆虫高度利用研究領域新素材開発グループ グループ長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：シルク材料工学
  1. シルク蛋白質の構造と物性に関する研究
  2. 新シルク素材の開発に関する研究
  3. 未知／未利用なシルクの探索と実用化に関する研究
GA

主な発表論文：

  1. “A study of the extraordinarily strong and tough silk produced by bagworms”, Nature Communications 2019, 10 (1), 1469.
  2. “Transdermal delivery of 40-nm silk fibroin nanoparticles”, Colloids and Surfaces B: Biointerfaces 2019, 175, 564-568.
  3. “Genome Editing Advances the Structural Study of Silk”, ACS Biomaterials Science & Engineering 2018, 4 (3), 832-835.
寺本英敏

寺本英敏 iD researchmap

農業・食品産業技術総合研究機構 生物機能利用研究部門絹糸昆虫高度利用研究領域新素材開発グループ グループ長補佐HP

筑波大学 グローバル教育院　
教授（協働大学院）

研究分野：シルク素材工学
  1. カイコの遺伝暗号拡張技術の開発
  2. 人工アミノ酸含有シルクの創製と素材利用に関する研究
  3. 高分子セリシンの加工技術開発と利用研究
GA

主な発表論文：

  1. “Characterization and Scaled-Up Production of Azido-Functionalized Silk Fiber Produced by Transgenic Silkworms with an Expanded Genetic Code”, International Journal of Molecular Sciences 2019, 20 (3), 616.
  2. “Genetic Code Expansion of the Silkworm Bombyx mori to Functionalize Silk Fiber”, ACS Synthetic Biology 2018, 7 (3), 801-806.
  3. “Azide-Incorporated Clickable Silk Fibroin Materials with the Ability to Photopattern”, ACS Biomaterials Science & Engineering 2016, 2 (2), 251-258.
冨田秀一郎

冨田秀一郎 researchmap

農業・食品産業技術総合研究機構 生物機能利用研究部門新産業開拓研究領域新特性シルク開発ユニット ユニット長HP

筑波大学 グローバル教育院　
教授（協働大学院）

研究分野：昆虫の発生生理学
  1. 昆虫の付属肢の発生と進化
  2. 昆虫発生の生理学的制御
  3. 付属肢再生の分子メカニズム
GA

主な発表論文：

  1. “BHR4 nuclear receptor coordinates the timing of pupal ecdysis through ecdysteroid biosynthesis in Bombyx mori”, Journal of Insect Biotechnology and Sericology 2012, 81 (2-3), 45-53.
  2. “Exploring the molecular phylogeny of phasmids with whole mitochondrial genome sequences”, Molecular Phylogenetics and Evolution 2011, 58 (1), 43-52.
  3. “Abd-B suppresses lepidopteran proleg development in posterior abdomen”, Developmental Biology 2009, 328 (2), 403-409.
須丸公雄

須丸公雄 iD

産業技術総合研究所 細胞分子工学研究部門 研究グループ長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：バイオ機能性高分子・光応答バイオ材料
  1. 光機能性高分子材料の開発とバイオ応用
  2. 細胞機能を引き出す培養システムの開発
  3. オンプレート細胞マニピュレーション技術の開発
GA

主な発表論文：

  1. “Photolithographic Fabrication of Semi 3-D Microstructures Composed of Flexible Hydrogel Sheet for in Vivo-like Cell Culture System”, ACS Applied Bio Materials 2019, 2 (10), 4129-4133.
  2. “Automated Adherent Cell Elimination by a High-Speed 1 Laser Mediated by a Light-Responsive Polymer”, Communications Biology 2018, 1-218, 1-9.
  3. “Photoresponsive Aqueous Dissolution of Poly(N-Isopropylacrylamide) Functionalized with o-Nitrobenzaldehyde through Phase Transition”, Biomacromolecules 2018, 19, 2913-2922.
寺村裕治

寺村裕治 iD researchmap

産業技術総合研究所 細胞分子工学研究部門
分子機能応用研究グループ上級主任研究員 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：バイオマテリアル工学、高分子化学、細胞工学、移植医療
  1. 細胞と臓器移植に役立つバイオマテリアルの研究・開発
  2. 細胞並びに血管内皮表面を修飾できる高分子材料の研究・開発
  3. エクソソーム・細胞をin vitroとin vivoで操作できる材料の研究・開発
GA

主な発表論文：

  1. “Cell Surface Functionalization with Heparin-Conjugated Lipid to Suppress Blood Activation”, Advanced Functional Materials 2021, 31, 2008167.
  2. “Potential of Cell Surface Engineering with Biocompatible Polymers for Biomedical Applications”, Langmuir 2020, 36, 41, 12088–12106.
  3. “Current status of ischemic stroke treatment: From thrombolysis to potential regenerative medicine”, Regenerative Therapy 2021, 18, 408-417.
平川秀彦

平川秀彦 iD TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系　准教授HP
領域コーディネーター

研究分野：酵素工学・タンパク質工学
  1. 選択的なタンパク質・酵素のアセンブリ
  2. シトクロムP450のエンジニアリング
  3. 酵素の固定化
GA

主な発表論文：

  1. ‘”Immobilization of a Bacterial Cytochrome P450 Monooxygenase System on a Solid Support”, Angew. Chem. Int. Ed. 2016, 55 (48), 15002-15006.
  2. ‘”Supramolecular protein assembly supports immobilization of a cytochrome P450 monooxygenase system as water-insoluble gel”, Sci. Rep. 2015, 5 (1), 8648.
  3. ‘”Ca2+-independent sortase-A exhibits high selective protein ligation activity in the cytoplasm of Escherichia coli“, Biotechnol. J. 2015, 10 (9), 1487-1492.

病態機構 領域

柳沢正史

柳沢正史 TRIOS researchmap

筑波大学 国際統合睡眠医科学研究機構 機構長・教授 HP

研究分野：睡眠神経科学
  1. 睡眠覚醒制御の根本的メカニズムの解明
  2. ランダム変異マウスを用いた睡眠覚醒を制御する遺伝子の大規模スクリーニング
  3. 睡眠覚醒異常に対する新規創薬シーズの探索・医薬化学
  4. 睡眠覚醒に関与する神経細胞活動の可視化とその制御
GA

主な発表論文：

  1. “Quantitative phosphoproteomic analysis of the molecular substrates of sleep need”, Nature 2018, 558 (7710), 435-439.
  2. “Nonpeptide orexin type-2 receptor agonist ameliorates narcolepsy-cataplexy symptoms in mouse models”, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 2017, 114 (22), 5731-5736.
  3. “Forward-genetics analysis of sleep in randomly mutagenized mice”, Nature 2016, 539 (7629), 378-383.
斉木臣二

斉木臣二 iD TRIOS researchmap

筑波大学 医学医療系　教授 HP

研究分野：パーキンソン病の早期診断・治療薬開発研究
  1. 前駆期パーキンソン病の診断バイオマーカーの開発
  2. パーキンソン病先制医療を実現する経口薬の開発
  3. 老化におけるオートファジーの意義を明らかにする

主な発表論文：

  1. “Systemic Metabolic Alteration Dependent on the Thyroid-Liver Axis in Early PD”, Annals of Neurology 2022, 93;2, 303-316pp.
  2. “Oxidative stress-induced phosphorylation of JIP4 regulates lysosomal positioning in coordination with TRPML1 and ALG2”, The EMBO Journal 2022, 41(22):e111476.
  3. “A metabolic profile of polyamines in parkinson disease: A promising biomarker”, Annals of Neurology 2019, 86:2, 251-263pp.
保富康宏

保富康宏 researchmap

医薬基盤・健康・栄養研究所 霊長類医科学研究センター センター長 HP

筑波大学 グローバル教育院　教授（協働大学院）

研究分野：免疫制御・ワクチン分野
  1. 免疫調節による疾患制御
  2. 感染症における病態制御

主な発表論文：

  1. “SOCS1 Antagonist–Expressing Recombinant Bacillus Calmette–Guérin Enhances Antituberculosis Protection in a Mouse Model”, The Journal of Immunology 2019, ji1800694.
  2. “Dynein Dysfunction Reproduces Age-Dependent Retromer Deficiency”, The American Journal of Pathology 2016, 186 (7), 1952-1966.
  3. “Suppressor of Cytokine Signaling 1 DNA Administration Inhibits Inflammatory and Pathogenic Responses in Autoimmune Myocarditis”, The Journal of Immunology 2012, 189 (4), 2043-2053.
林洋平

林洋平iD

理化学研究所 バイオリソース研究センター
iPS細胞高次特性解析開発チーム　チームリーダー HP

筑波大学 グローバル教育院　教授（協働大学院）

研究分野：幹細胞生物学、再生医学、iPS細胞
  1. 疾患(患者)特異的iPS細胞を用いた病態研究・創薬
  2. iPS細胞へのリプログラム化メカニズムの解明と改良
  3. 細胞培養、細胞操作、細胞解析の新規技術開発

主な発表論文：

  1. “Cell-autonomous correction of ring chromosomes in human induced pluripotent stem cells”, Nature 2014, 507, 99-103.
  2. “Structure-based discovery of NANOG variant with enhanced properties to promote self-renewal and reprogramming of pluripotent stem cells”, PNAS 2015, 112(15), 4666-4671.
  3. “BMP-SMAD-ID promotes reprogramming to pluripotency by inhibiting p16/INK4A-dependent senescence”, PNAS 2016, 113(46), 13057-13062.
三輪佳宏

三輪佳宏 iD

理化学研究所 バイオリソース研究センター
遺伝子材料開発室室長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

 
研究分野：バイオイメージング、遺伝子バンク
  1. 疾患モデルマウス近赤外非侵襲ライブイメージング
  2. コラーゲンライブイメージングによる線維症と３次元組織形成の解析
GA

主な発表論文：

  1. “A Novel iRFP-Incorporated in vivo Murine Atherosclerosis Imaging System”, Scientific Reports 2018, 8, 14515.
  2. “Fluorescence and Bioluminescence Imaging of Angiogenesis in Flk1-Nano-lantern Transgenic Mice”, Scientific Reports 2017, 46597.
  3. “In Vivo image Analysis Using iRFP Transgenic Mice”, Experimental Animals 2014, 63(3), 311-319.
吉木淳

吉木淳iD

理化学研究所 バイオリソース研究センター
実験動物開発室　室長 HP

筑波大学 グローバル教育院　教授（協働大学院）

研究分野：マウスリソース学
  1. マウスリソースの収集・保存・品質管理・提供
  2. マウスリソースの品質管理のための開発研究
  3. 遺伝子機能の解析ツールおよびヒト疾患マウスモデルの開発
GA

主な発表論文：

  1. “Off- and on-target effects of genome editing in mouse embryos”, Journal of Reproduction and Development 2019, 65 (1), 1-5.
  2. “Characterization of novel dystonia musculorum mutant mice: Implications for central nervous system abnormality”, Neurobiology of Disease 2016, 96, 271-283.
  3. “High-throughput discovery of novel developmental phenotypes”, Nature 2016, 537, 508–514.

久野　敦iD

産業技術総合研究所 細胞分子工学研究部門
分子細胞マルチオミクス研究グループ　研究グループ長 HP

筑波大学 グローバル教育院　教授（協働大学院）

研究分野：糖鎖医工学
  1. 糖鎖バイオマーカー・糖鎖標的開発と橋渡し
  2. グライコプロテオームアトラスの構築
  3. 全自動糖鎖プロファイリングシステムの実用化
GA

主な発表論文：

  1. “Discovery of pancreatic ductal adenocarcinoma-related aberrant glycosylations: a multilateral approach of lectin microarray-based tissue glycomic profiling with public transcriptomic datasets”, Froniers in Oncology 2020, 10, 338.
  2. “LM-GlycomeAtlas Ver. 2.0: An integrated visualization for lectin microarray-based mouse tissue glycome mapping data with lectin histochemistry”, J Proteome Res 2021, 20, 2069-2075.
  3. “Lectin bead array in a single tip facilitates fully automatic glycoprotein profiling”, Scientific Reports 2019, 191 11162-11169.
木田泰之

木田泰之iD

産業技術総合研究所 細胞分子工学研究部門
ステムセルバイオテクノロジー研究グループ　研究グループ長 HP

筑波大学 グローバル教育院　教授（協働大学院）

研究分野：幹細胞工学
  1. ヒト多能性幹細胞を用いた生体外臓器間ネットワーク再構築技術の開発
  2. 固形がんの難治性を克服するためのがん代謝メカニズムの解明
  3. 幹細胞を用いた，疾患ならび創薬研究への支援技術開発
GA

主な発表論文：

  1. “Selective Induction of Human Autonomic Neurons Enables Precise Control of Cardiomyocyte Beating”, Scientific Reports 2020, 10, 9464.
  2. “Adipose-derived mesenchymal stem cells differentiate into heterogeneous cancer-associated fibroblasts in a stroma-rich xenograft model”, Scientific Reports 2021, 11, 4690.
  3. “Fabrication of Perfusable Vascular Channels and Capillaries in 3D Liver-like Tissue”, Scientific Reports 2020, 10, 5646.

田尻和子 researchmap

国立がん研究センター東病院
循環器科 科長 HP

筑波大学 グローバル教育院　准教授（グローバル教育院）

研究分野：循環器内科学、腫瘍循環器学
  1. 循環器内科学
  2. 腫瘍循環器学

主な発表論文：

  1. “Immune checkpoint inhibitor-related myositis overlapping with myocarditis: An institutional case series and a systematic review of literature.”, Frontiers in Pharmacology 2022, 13,884776.
  2. “Risk Factors and In-Hospital Outcomes of Perioperative Atrial Fibrillation for Patients with Cancer: A Meta-Analysis.”, Annals of Surgical Oncology 2022
  3. “Atherosclerotic cardiovascular events associated with immune checkpoint inhibitors in cancer patients.”, Japanese Journal of Clinical Oncology 2022, 52, 651-656.
尾崎遼

尾崎　遼 iD TRIOS researchmap

筑波大学 医学医療系　准教授 HP

研究分野：バイオインフォマティクス・計算生物学
  1. ゲノム配列および細胞の機能予測
  2. 生命科学研究の自動化
  3. 医学データ解析
GA

主な発表論文：

  1. “Single-cell full-length total RNA sequencing uncovers dynamics of recursive splicing and enhancer RNAs”, Nature Communications 2018, 9, 619.
  2. “SAGAS: Simulated annealing and greedy algorithm scheduler for laboratory automation”, SLAS Technology 2023, 19:34.
  3. “Cell-to-cell interaction analysis of prognostic ligand-receptor pairs in human pancreatic ductal adenocarcinoma”, Biochem Biophys Rep. 2021, 28:101126.
許 東洙

許 東洙 TRIOS researchmap

筑波大学 医学医療系　准教授
領域コーディネーター

研究分野：循環器内科学
  1. 不整脈
  2. 心不全

主な発表論文：

  1. “Concomitant SK current activation and sodium current inhibition cause J wave syndrome”, JCI Insight 2018, 3 (22), e122329.
  2. “Phospholamban regulates nuclear Ca2+ stores and inositol 1,4,5-trisphosphate mediated nuclear Ca2+ cycling in cardiomyocytes”, Journal of Molecular and Cellular Cardiology 2018, 123, 185-197.
  3. “Predicting atrial fibrillation: can we shape the future?”, European Heart Journal 2014, 36 (3), 145-147.

創薬開発 領域

市川創作

市川創作 iD TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系　教授
プログラムリーダー

研究分野：機能性キャリア開発工学
  1. エマルションキャリアシステムの開発と特性解明
  2. リポソームキャリアシステムの開発と特性解明
  3. 生理活性成分の効率的送達のための新規ナノ/マイクロキャリアシステムの開発
GA

主な発表論文：

  1. “Freeze-dryable lipid vesicles with size tunability and high encapsulation efficiency prepared by the multiple emulsification-solvent evaporation method”, Colloids and Surfaces B: Biointerfaces 2017, 159, 412-418.
  2. “Mixing characterization of liquid contents in human gastric digestion simulator equipped with gastric secretion and emptying”, Biochemical Engineering Journal 2017, 122, 85-90.
  3. “Development and Fundamental Characteristics of a Human Gastric Digestion Simulator for Analysis of Food Disintegration”, Japan Agricultural Research Quarterly: JARQ 2017, 51 (1), 17-25.
礒田博子

礒田博子 iD TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系　教授 HP

研究分野：天然物創薬探索
  1. 地域伝承薬からの新規薬用成分の探索
  2. 薬用成分の作用メカニズムの解明

主な発表論文：

  1. “3,4,5-Tricaffeoylquinic acid induces adult neurogenesis and improves deficit of learning and memory in aging model senescence-accelerated prone 8 mice”, Aging 2019, 11 (2), 401-422.
  2. “Anti-inflammatory marine cyclic peptide stylissatin A and its derivatives inhibit differentiation of murine preadipocytes”, Chemical Communications 2019, 55 (38), 5471-5474.
  3. “Evaluation of maslinic acid with whole-body vibration training in elderly women with knee osteoarthritis”, PLOS ONE 2018, 13 (3), e0194572.
富永健一

富永健一 iD

産業技術総合研究所
食薬資源工学オープンイノベーションラボラトリ 副ラボ長

筑波大学 グローバル教育院　教授（協働大学院）

研究分野：触媒化学
  1. バイオマスの触媒変換による有用化学品合成
  2. 二酸化炭素の触媒変換による有用化学品合成
  3. 均一系触媒の固体触媒化

主な発表論文：

  1. “Isorhamnetin Alleviates Steatosis and Fibrosis in Mice with Nonalcoholic Steatohepatitis”, Sci Rep 2019, 9, 16210.
  2. “Mixed-acid systems for the catalytic synthesis of methyl levulinate from cellulose”, Green Chemistry 2011, 13, 810-812.
  3. “An environmentally friendly hydroformylation using carbon dioxide as a reactant catalyzed by immobilized Ru-complex in ionic liquids”, Catalysis Today 2006, 115 (1-4), 70-72.

有村隆志 iD

産業技術総合研究所
産総研・筑波大　食薬資源工学オープンイノベーションラボラトリ 招聘研究員

筑波大学 グローバル教育院　教授（協働大学院）

研究分野：有機合成化学・超分子
  1. 未利用生物資源の官能基変換
  2. 応答機能を有する自励分子システムの創製
  3. 分子ロボティクス・構造化ゲルと化学反応場の協働による運動創発

主な発表論文：

  1. “Synthesis of 2-(2-Hydroxyethoxy)-3-hydroxysqualene and Characterization of Its Anti-Inflammatory Effects”, BioMed Research International 2020, 2020, 9584567.
  2. “Electrochemically Switchable Molecular-Tweezers”, Journal of Oleo Science 2017, 66 (4), 419-423.
  3. “A Belousov–Zhabotinsky Oscillator Driven by a Water‐Soluble Metalloporphyrin”, Chemistry Select 2016, 1 (4), 877-878.
沓村憲樹

沓村憲樹 iD TRIOS researchmap

筑波大学 数理物質系（化学域） 教授 HP

研究分野：有機合成化学、創薬化学
  1. 睡眠／覚醒に関与するオレキシン受容体に作用するリガンドの設計・合成
  2. 生理活性を有する含窒素複素環化合物の合成
  3. 創薬に有用な化学選択的反応に関する研究

主な発表論文：

  1. “Total Syntheses of 3-epi-Litsenolide D2 and Lincomolide A”, J. Org. Chem. 2018, 83 (18), 11450-11457.
  2. “Favorskii-Type Rearrangement of the 4,5-Epoxymorphinan Skeleton”, Org. Lett. 2018, 20 (6), 1559-1562.
  3. “Design and Synthesis of Non-Peptide, Selective Orexin Receptor 2 Agonists”, J. Med. Chem. 2015, 58 (20), 7931-7937.
櫻井鉄也

櫻井鉄也 iD TRIOS researchmap

筑波大学 人工知能科学センター センター長
システム情報系 教授 HP

研究分野：数理アルゴリズム
  1. データ解析における数理手法
  2. 大規模科学シミュレーションの高性能計算
  3. 固有値解析
GA

主な発表論文：

  1. “Distributed collaborative feature selection based on intermediate representation”, Proceedings of the 28th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI-19) 2019, 4142-4149.
  2. “Complex moment-based supervised eigenmap for dimensionality reduction”, Proceedings of the Thirty-Third AAAI Conference on Artificial Intelligence (AAAI-19) 2019, 3910-3918.
  3. “Spectral feature scaling method for supervised dimensionality reduction”, Proceedings of the 27th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI-18) 2018, 2560-2566.
Shinji Sugiura

杉浦慎治 iD researchmap

産業技術総合研究所 細胞分子工学研究部門
ステムセルバイオテクノロジー研究グループ　上級主任研究員 HP

筑波大学 グローバル教育院　教授（協働大学院）

研究分野：生物化学工学
  1. Organs-on-a-chip デバイスの開発と創薬への応用
  2. 細胞培養における微小環境制御技術の開発
  3. 機能性材料を利用した細胞プロセス工学に関する研究
GA

主な発表論文：

  1. “A multi-throughput multi-organ-on-a-chip system on a plate formatted pneumatic pressure-driven medium circulation platform”, Lab on a Chip 2018, 18 (1), 115-125.
  2. “Morphology-based optical separation of subpopulations from a heterogeneous murine breast cancer cell line”, PLOS ONE 2017, 12 (6), e0179372.
  3. “Click-crosslinkable and photodegradable gelatin hydrogels for cytocompatible optical cell manipulation in natural environment”, Scientific Reports 2015, 5 (1), 15060.
宮岸真

宮岸真 iD researchmap

産業技術総合研究所 健康医工学研究部門
分子複合生理研究グループ　研究グループ長 HP

筑波大学 グローバル教育院　教授（協働大学院）

研究分野：核酸医薬
  1. 核酸アプタマー取得法の開発
  2. 核酸触媒（リボザイム、DNAzyme)の取得とその解析
  3. 核酸医薬品開発に係る基礎研究

主な発表論文：

  1. “Identification of XBP1-u as a novel regulator of the MDM2/p53 axis using an shRNA library”, Science Advances 2017, 3 (10), e1701383.
  2. “Transcription Factor YY1 Contributes to Tumor Growth by Stabilizing Hypoxia Factor HIF-1 in a p53-Independent Manner”, Cancer Research 2013, 73 (6), 1787-1799.
  3. “Determination of the Role of DDX3 a Factor Involved in Mammalian RNAi Pathway Using an shRNA-Expression Library”, PLoS ONE 2013, 8 (3), e59445.
野田尚宏

野田尚宏iD

産業技術総合研究所 バイオメディカル研究部門
バイオアナリティカル研究グループ 研究グループ長 HP

筑波大学 グローバル教育院 准教授（協働大学院）

研究分野：生物工学・生体分子解析技術分野
  1. 生体分子解析技術の開発
  2. 環境微生物制御技術の開発
  3. バイオテクノロジー標準化エキスパート養成

主な発表論文：

  1. “Fluorescent nucleic acid probe in droplets for bacterial sorting (FNAP-sort) as a high-throughput screening method for environmental bacteria with various growth rates”, PLOS ONE 2019, 14 (4), e0214533.
  2. “Bacterial Cell Culture at the Single-cell Level Inside Giant Vesicles”, Journal of Visualized Experiments, 2019, 146, e59555.
  3. “Absolute Quantification of RNA Molecules Using Fluorescence Correlation Spectroscopy with Certified Reference Materials”, Analytical Chemistry 2018, 90 (18), 10865-10871.
須丸公雄

須丸公雄 iD

産業技術総合研究所 細胞分子工学研究部門 研究グループ長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：バイオ機能性高分子・光応答バイオ材料
  1. 光機能性高分子材料の開発とバイオ応用
  2. 細胞機能を引き出す培養システムの開発
  3. オンプレート細胞マニピュレーション技術の開発
GA

主な発表論文：

  1. “Photolithographic Fabrication of Semi 3-D Microstructures Composed of Flexible Hydrogel Sheet for in Vivo-like Cell Culture System”, ACS Applied Bio Materials 2019, 2 (10), 4129-4133.
  2. “Automated Adherent Cell Elimination by a High-Speed 1 Laser Mediated by a Light-Responsive Polymer”, Communications Biology 2018, 1-218, 1-9.
  3. “Photoresponsive Aqueous Dissolution of Poly(N-Isopropylacrylamide) Functionalized with o-Nitrobenzaldehyde through Phase Transition”, Biomacromolecules 2018, 19, 2913-2922.
田端健司

田端健司

アステラス製薬株式会社 開発研究部門　ディスカバリーインテリジェンス 所長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：臨床薬物動態学,　創薬研究,　トランスレーショナルサイエンス
  1. モダリティ研究
  2. AI創薬
  3. ロボットと自動化（DX）
GA

主な発表論文：

  1. “Application of a physiologically based pharmacokinetic model for the prediction of mirabegron plasma concentrations in a population with severe renal impairment.” Biopharmaceutics & Drug Disposition. 2019, 40, 176-187.
  2. “Quantitative LC/ESI-SRM/MS of antibody biopharmaceuticals: use of a homologous antibody as an internal standard and three-step method development.” Analytical Bioanalytical Chemistry. 2017, 409, 5523-5532.
  3. “Recent progress in hepatocyte culture models and their application to the assessment of drug metabolism, transport, and toxicity in drug discovery: The value of tissue engineering for the successful development of a microphysiological system.” Journal of Pharmaceutical Sciences. 2017, 106, 2302-2311.
藤村 高穂

藤村 高穂

アステラス製薬　非臨床バイオメディカルサイエンス
トラスレーショナルサイエンス推進グループ
課長 HP

筑波大学 グローバル教育院 教授（協働大学院）

研究分野：創薬研究,　トランスレーショナルサイエンス
  1. バイオマーカー研究
  2. ヒト試料を用いた臨床予測研究
  3. 個別化医療研究
GA

主な発表論文：

  1. “Translational research in drug discovery – current issues and perspectives”, Nihon Yakurigaku Zasshi 2016, 148, 296-301.
  2. “Expression and possible functional role of the beta3-adrenoceptor in human and rat detrusor muscle”, J Urol 1999, 161, 680-685.
  3. “A selective peroxisome proliferator-activated receptor gamma modulator with distinct fat cell regulation properties”, J Pharmacol Exp Ther 2006, 863-871.
Kouichiro Oisaki

生長幸之助 iD

産業技術総合研究所 触媒化学融合研究センター
　主任研究員HP

筑波大学 グローバル教育院　
准教授（協働大学院）

研究分野：有機合成化学、医薬化学、均一系触媒、ペプチド/タンパク質化学
  1. 複雑化合物合成のための触媒的変換法
  2. ペプチド/タンパク質およびハイブリッド化合物の生体適合変換
  3. 低分子化合物・化学修飾型生物製剤の創薬化学
GA

主な発表論文：

  1. “Development of Highly Chemoselective Oxidative Transformations by Designing Organoradicals”, Chemical and Pharmaceutical Bulletin 2018, 66(10), 907-919.
  2. “Protein Modification at Tyrosine with Iminoxyl Radicals”, J. Am. Chem. Soc. 2021, 143(47), 19844–19855.
  3. “Induction of ADCC by a folic acid–mAb conjugate prepared by tryptophan-selective reaction toward folate-receptor-positive cancer cells”, RSC Advancess 2022, 54.
宮前友策

宮前友策 iD TRIOS researchmap

筑波大学 生命環境系 准教授 HP
領域コーディネーター

研究分野：ケミカルバイオロジー
  1. 小分子化合物を用いた細胞内タンパク質分解系の制御および検出
  2. 核内受容体リガンドの創薬化学的研究
  3. 生物が作り出す天然由来化合物のケミカルバイオロジー
GA GA

主な発表論文：

  1. “A method for conditional regulation of protein stability in native or near-native form”, Cell Chemical Biology 2020, 27, 1-9.
  2. “A strategy for orthogonal deubiquitination using a bump-and-hole aproach”, RSC Chemical Biology 2023, 4, 879-883.
  3. “Ubiquitin-Derived Fragment as a Peptide Linker for the Efficient Cleavage of a Target Protein from a Degron”, ACS Chemical Biology 2024, 19, 497-505.